openslideのインストール方法
こんばんは。
今回は、解像度がとても高く普通に開くことのできないファイル（ndpiとか）をpythonで扱えるようにするライブラリopenslideのインストール方法をお話しします。
自身の研究で組織検査画像を扱う必要があったためです。ちなみに筆者はWindows10(64bit)でanacondaで環境構築をしており、pythonは2.7を使用しています。
- Install Openslide
まず、Openslideのホームページに行きWindows Binariesの2017-11-22 64-bitをダウンロードします。
適当な場所に展開します。
- dllファイルのコピー
展開したファイルの中のbinフォルダに入っているdllファイル(20個)をpythonの実行環境(python.exe)があるフォルダに全部移します。インストールしたい仮想環境の場所に移します。
自分の場合はanacondaで環境構築しているので(C:\Users\kazut\anaconda3\envs\skin)に置きました。
- openslide-pythonのインストール
その後、anaconda promptを開きインストールする予定の仮想環境に入り
pip install open-slide
とコマンドを打ちます。あとは
import openslide
でpassすることができました。
